Astronómicamente la estación de Invierno, comenzará en nuestro País, el 21 de junio del 2015 a las 11 horas con 38 minutos y se prolongará hasta el 23 de setiembre del 2015 a las 03 horas, con 20 minutos, momento en que se dará inicio la siguiente estación que es la primavera.
Las temperaturas más bajas se observarán entre los meses de julio a agosto, donde el cielo se presentará nublado en las primeras y últimas horas del día y casi despejado alrededor del mediodía. En este periodo las precipitaciones serán deficientes y esporádicas, causadas principalmente, por el ingreso de sistemas frontales, asociados a eventos conocidos como friajes, creando condiciones extremas de mal tiempo y descenso brusco de la temperatura.
Históricamente las temperaturas más bajas que se han registrado, en invierno en San Martín, corresponden a las ciudades de Moyobamba con 9.2 °C, Rioja 9.4 °C, Tarapoto, Lamas y Navarro con 10.5 °C, Sauce, Bellavista y Juan Guerra con 11.0 °C y; Tocache, Naranjillo y Soritor con 12.0 °C.
En el Alto Mayo, en las ciudades de Rioja y Moyobamba, las temperaturas que se vienen registrando, oscilan entre 17 y 28 °C, para la mínima y la máxima, respectivamente y en el mes de setiembre, se presentarán, en promedio, entre 18 y 29 °C.
En el Bajo Mayo, en la ciudad de Tarapoto, la temperatura diaria viene oscilando entre 20 y 31 °C, y en el mes de setiembre se observarán, en promedio, entre 21 y 32 °C.
En el Huallaga Central, en las ciudades de Bellavista y Juanjui, las temperaturas fluctuarán entre 20 y 32 °C, y en setiembre oscilarán entre 21 y 33 °C.
En el Alto Huallaga, en la ciudad de Tocache, se reporta una temperatura que oscila entre 19 y 32 °C, y en el mes de setiembre los termómetros marcarán de 21° a 33 °C.
En tanto, en el Bajo Huallaga, en las localidades de Pongo de Caynarachi, Pelejo y Navarro, la temperatura oscila entre 20 y 31 °C, y en el mes de setiembre se observarán entre 21 y 32 °C.
También se observará, en esta estación, una mayor frecuencia en la formación de nieblas y neblinas, sobre todo, en las inmediaciones de las carreteras y de los grandes ríos de la región, debido a la formación de inversiones térmicas de superficie, por lo que las personas que transitan por estos lugares, deberán tomar las precauciones antes los riesgos que ocasiona la poca visibilidad sobre todo en horas de la madrugada.
En invierno, se presentan las mayores variaciones diarias de temperatura del año, asociadas al incremento de las infecciones respiratorias agudas (IRAs), afectando básicamente a los niños, mujeres gestantes y ancianos. Las provincias, cuyos habitantes sufren el mayor impacto son: Rioja, Picota, Moyobamba, El Dorado, Huallaga y San Martín. Tienen un moderado impacto en Mariscal Cáceres, Tocache y Bellavista y; soporta un impacto débil, la provincia de Lamas.
En estos meses se caracterizan, por tener la menor nubosidad del año, se producen las más grandes diferencias de temperatura y presión atmosférica entre los valles y las montañas, presentándose temporales, que algunas veces ocurren formando remolinos, acompañados de polvo y en muchas ocasiones, aparecen asociados a tormentas eléctricas y precipitaciones. Estos vientos tienen ráfagas mayores a 62 km/h y producen daños en sembríos, techos, postes, torres y otras instalaciones.
Las características meteorológicas de invierno, favorecen las actividades al aire libre, las de turismo y las cosechas de arroz que usualmente se dan entre los meses de junio a julio. Las tierras de los cultivos de secano se encuentran, generalmente, en descanso.
Por otro lado, los caudales de los ríos que comenzaron a descender, a comienzos de junio, alcanzarán sus niveles mínimos, al finalizar el invierno.