El martes 12 de abril harán la programación del campeonato de segunda, desde las 12.00 horas en el auditorio del complejo deportivo de la Federación Peruana de Fútbol, se realizará el sorteo oficial perteneciente al Torneo Descentralizado – Segunda División 2016. Como es de conocimiento este año, además de los clubes ya existentes se suman los clubes que descendieron de Primera División, Cienciano del Cusco y Sport Loreto. Asimismo la Academia Cantolao, segundo en la Copa Perú 2015, así como los equipos que por licencia y orden de méritos de la etapa nacional de la Copa Perú, como Sport Ancash FC, Unión Tarapoto, Cultural Santa Rosa de Andahuaylas y Alfredo Salinas del Cusco.